Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9Y3F1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9Y3F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9Y3F1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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