Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF1Q9Y375 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms