Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHDC2Q9Y2U9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms