Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINS2Q9Y248 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINS2Q9Y248 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms