Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP4E1Q9UPM8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4E1Q9UPM8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms