Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRQQ9UMZ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms