Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX12Q9UMY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms