Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKLN1Q9UL63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKLN1Q9UL63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKLN1Q9UL63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms