Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP21Q9UK80 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP21Q9UK80 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
USP21Q9UK80 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USP21Q9UK80 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP21Q9UK80 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms