Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO3A1Q9UIG8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms