Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms