Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms