Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SWAP70Q9UH65 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SWAP70Q9UH65 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SWAP70Q9UH65 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms