Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA9Q9UGM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms