Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms