Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCF2Q9UG63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCF2Q9UG63 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCF2Q9UG63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms