Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM10Q9UDY6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms