Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMC3IPQ9P2W1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms