Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL42Q9P2K6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL42Q9P2K6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms