Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN3Q9P1Z3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN3Q9P1Z3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCN3Q9P1Z3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms