Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHRF1Q9P1Y6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHRF1Q9P1Y6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PHRF1Q9P1Y6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms