Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCHIP1Q9P0W5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms