Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2AFY2Q9P0M6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFY2Q9P0M6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms