Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDP1Q9P0J1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDP1Q9P0J1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDP1Q9P0J1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms