Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDE1Q9NZC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDE1Q9NZC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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