Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C9orf78Q9NZ63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
C9orf78Q9NZ63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms