Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL39Q9NYK5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL39Q9NYK5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms