Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN3BQ9NY72 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms