Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCM9Q9NXL9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM9Q9NXL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms