Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOR4AQ9NXH8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR4AQ9NXH8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms