Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM248Q9NWD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms