Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ9

FAM49B, Protein FAM49B, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49BQ9NUQ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM49BQ9NUQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM49BQ9NUQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49BQ9NUQ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49BQ9NUQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49BQ9NUQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49BQ9NUQ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49BQ9NUQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49BQ9NUQ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms