Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACER3Q9NUN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms