Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC3Q9NUD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms