Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
PDS5BQ9NTI5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PDS5BQ9NTI5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PDS5BQ9NTI5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
PDS5BQ9NTI5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
PDS5BQ9NTI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms