Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GKN1Q9NS71 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms