Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASSF1Q9NS23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASSF1Q9NS23 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASSF1Q9NS23 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASSF1Q9NS23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF1Q9NS23 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF1Q9NS23 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms