Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HELLSQ9NRZ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HELLSQ9NRZ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms