Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms