Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBQLN4Q9NRR5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBQLN4Q9NRR5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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