Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTPS2Q9NRF8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS2Q9NRF8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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