Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLE4Q9NR33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE4Q9NR33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE4Q9NR33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms