Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRCC1Q9NPI7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRCC1Q9NPI7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRCC1Q9NPI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms