Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPCPD1Q9NPB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms