Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCM1Q9NP62 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCM1Q9NP62 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms