Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE7BQ9NP56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE7BQ9NP56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE7BQ9NP56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms