Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM8AQ9HCN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms