Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH9Q9HC56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDH9Q9HC56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH9Q9HC56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms