Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPV4Q9HBA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPV4Q9HBA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms