Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTN4Q9HB63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NTN4Q9HB63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTN4Q9HB63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 477.2 ms